Michaelis-Menten-Theorie

Modelliere die Enzymkinetik mit der Michaelis-Menten-Gleichung und vergleiche unterschiedliche Hemmeffekte.

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Die Sättigung ist asymptotisch – und quälend langsam 🖖

Die Kurve nähert sich Vmax, erreicht es aber nie, und wie langsam das geschieht, sollte man vor Augen haben. Da v/Vmax = [S]/(Km + [S]) gilt, kostet halbe Geschwindigkeit genau ein Km an Substrat. 90 % kosten neun. 99 % kosten neunundneunzig. Setze [S] im Werkzeug auf Km und lies 0,5·Vmax ab; verhundertfache [S], und die Decke ist immer noch nicht berührt. Deshalb lässt sich Vmax nie direkt messen – es wird aus einem Fit abgelesen, nie von einer Anzeige, und genau darum wurde der Kehrwert-Plot im nächsten Block überhaupt erfunden.

Die Kurve zum Ablesen begradigen 🖖

Das Lineweaver-Burk-Diagramm des Tools formt die Gleichung um zu 1/v = (Km/Vmax)(1/[S]) + 1/Vmax und macht aus der gekrümmten Sättigungskurve eine Gerade. Bevor es Software zur Kurvenanpassung gab, konnte man die Linie mit dem Lineal verlängern und die Konstanten direkt ablesen: Der y-Achsenabschnitt liefert 1/Vmax, der x-Achsenabschnitt -1/Km. Der Haken: Punkte bei kleinem [S] dominieren wegen ihrer großen Kehrwerte die Anpassung und überzeichnen Messfehler.

Dieselbe Kurve steckt überall 🖖

Diese gleichseitige Hyperbel ist nicht auf Enzyme beschränkt. Dieselbe Form erscheint als Langmuir-Adsorptionsisotherme für Gasmoleküle, die an einer Oberfläche haften, als Monod-Gleichung für mikrobielles Wachstum in Abhängigkeit vom Nährstoffangebot und als Hill-Gleichung für die Sauerstoffbindung an Hämoglobin. Jedes System mit einer festen Zahl allmählich sättigender Bindungsstellen erzeugt diese Form – Vmax und Km anzupassen heißt also, eine Maximalkapazität und einen Halbsättigungspunkt zu bestimmen.

Aufgabe vollständig gelöst

  1. Ein Enzym mit V max = 100 und K m = 5 5 Schritte

    Ein Enzym mit Vmax = 100 und Km = 5. Zeigen Sie, was Km tatsächlich misst, und berechnen Sie dann, wie viel Substrat benötigt wird, um von 10 % der Maximalgeschwindigkeit auf 90 % zu kommen.

    1. Das Geschwindigkeitsgesetz beschreibt eine Sättigungskurve: proportional zum Substrat bei geringer Konzentration, flach bei hohem Überschuss. Km ist die einzige Größe, die bestimmt, wo der Übergang stattfindet.

    2. Setzt man [S] gleich Km, vereinfacht sich der Ausdruck. Km ist die Halbsättigungskonzentration — keine Geschwindigkeit, keine Bindungsenergie und keine Eigenschaft, die man am flachen Teil der Kurve ablesen kann.

    3. Invertieren Sie das Geschwindigkeitsgesetz für die umgekehrte Frage: Welche Konzentration ergibt einen bestimmten Anteil von Vmax?

    4. Zehn Prozent benötigen ein Neuntel von Km; neunzig Prozent das Neunfache davon.

    5. Die mittleren 80 % der Kurve erstrecken sich also über einen einundachtzigfachen Substratbereich.

    Antwort

    Das Werkzeug gibt Vmax = 100,00 und Km = 5,00 aus. Die 81 ist die Zahl, auf die es im Labor ankommt. Die Sättigung wird so langsam erreicht, dass man Vmax nicht durch Zugabe von mehr Substrat messen kann — um 99 % zu erreichen, wären 99 Km erforderlich, und um sie exakt zu erreichen, unendlich viel —, weshalb Vmax immer durch Kurvenanpassung bestimmt wird und nie durch direkte Beobachtung. Das ist auch der Grund, warum das Lineweaver–Burk-Diagramm erfunden wurde und warum heute davon abgeraten wird: Die Bildung von Kehrwerten führt dazu, dass die dicht beieinander liegenden, verrauschten Messpunkte bei niedriger Konzentration die Anpassung dominieren. Wechseln Sie den Diagrammtyp und beobachten Sie, welche Punkte sich verteilen.

Quellen (2)

Beispielaufgaben

  • Typisch - Vmax 100.00 bei Km 5.00 — und bei einer Substratkonzentration gleich Km ist die Rate genau die Hälfte, 50.00.
  • Hohe Affinität - Ein festeres Enzym: Km fällt auf 0.50, halbmaximale Rate also schon bei einem Zehntel des Substrats.
  • Kompetitive Hemmung - Ein kompetitiver Hemmstoff hebt das scheinbare Km auf 13.33 und lässt Vmax bei 100.00.
  • Nicht-kompetitive Hemmung - Nichtkompetitive Hemmung macht das Gegenteil — Vmax sinkt auf 37.50, Km bleibt bei 5.00.