DNAコドン翻訳ツール
DNA配列を入力すると、そのRNAコドン、アミノ酸翻訳、GC含量を確認できます。
インタラクティブシミュレーションを読み込んでいます...
暗号の縮重と起源 🖖
遺伝暗号は地球上の生命の共通言語であり、64通りの3文字コドンの組み合わせを20種類のアミノ酸に対応させています。アミノ酸よりもコドンの数が多いため、この暗号は縮重(冗長)しています。ほとんどのアミノ酸は複数のコドンによって指定され、それらは通常3番目の塩基のみが異なります。この「ゆらぎ(wobble)」ペアリングとして知られる現象は、重要な生物学的緩衝材として機能します。DNA配列の多くの1点突然変異は、得られるアミノ酸配列を変化させず、有害な遺伝的変化から生物を保護します。暗号の構造は翻訳エラーの影響を最小限に抑えるよう高度に最適化されています。
生命を3文字ずつ読む 🖖
細胞はDNAを重なりのない3つの塩基のまとまり、すなわちコドンとして読み取ります。翻訳は開始コドン ATG(メチオニンもコードする)から始まり、終止シグナル TAA・TAG・TGA に達するまでコドンごとに進みます。このツールは配列をこれらの三つ組に分割し、それぞれが指定するアミノ酸を表示します。重要なのは読み始める位置で、開始点を1塩基ずらすだけで以降のすべてのコドンが変わり、まったく別のタンパク質ができます。
「普遍的」なコードにも方言がある 🖖
遺伝暗号はほぼ普遍的ですが、完全ではありません。あなた自身のミトコンドリアは、細胞の他の部分とは違う読み方をします。通常は終止シグナルの TGA はトリプトファンとして読まれ、ATA はイソロイシンではなくメチオニンになり、AGA・AGG はアルギニンから終止へと変わります。単細胞の繊毛虫の中には、終止コドンをグルタミンに読み替えるものさえいます。つまり同じ三つ組でも、どのゲノムが読むかによって意味が変わるのです。
例題
- 開始コドン - ATG開始 → Lys-Arg-Phe-Ala-終止
- GCリッチ - GCリッチな配列: 高い熱安定性
- オープンリーディングフレーム - 内部にMetを含むオープンリーディングフレーム
- 変異解析 - 塩基置換確率の解析