Como é uma sequência real
Cinco sequências que vale a pena conhecer — e uma que não é um gene
A caixa acima começa com dezoito bases inventadas. Estas cinco são reais: quatro grelhas de leitura tiradas das bases de dados de sequências e um famoso troço de ADN que não o é. Clica numa delas para a carregar na ferramenta.
| Sequência | Bases | Comprimento | GC | Traduz-se em |
|---|---|---|---|---|
| β-globina humana, primeiros oito codões | ATGGTGCATCTGACTCCTGAGGAG |
24 pb | 54,2% | Met-Val-His-Leu-Thr-Pro-Glu-Glu |
| A mesma, com a alteração da anemia falciforme | ATGGTGCATCTGACTCCTGTGGAG |
24 pb | 54,2% | Met-Val-His-Leu-Thr-Pro-Val-Glu |
| Proteína verde fluorescente, início | ATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGA |
30 pb | 36,7% | Met-Ser-Lys-Gly-Glu-Glu-Leu-Phe-Thr-Gly |
| Péptido sinal da pré-pró-insulina, início | ATGGCCCTGTGGATGCGCCTCCTGCCCCTGCTG |
33 pb | 69,7% | Met-Ala-Leu-Trp-Met-Arg-Leu-Leu-Pro-Leu-Leu |
| O contexto de Kozak — não é uma grelha de leitura | GCCACCATGG |
10 pb | 70,0% | Ala-Thr-Met |
Lê as duas primeiras linhas em conjunto: mais nada nesta página pesa tanto. Diferem numa única base em vinte e quatro, a vigésima, e a coluna da tradução transforma isso em: Glu passa a Val na sétima posição. Essa substituição única é a anemia falciforme. O resto é escala e variedade: o GC vai de 36,7 % numa proteína de medusa a 69,7 % no péptido sinal da insulina humana, portanto ser rico em GC diz mais sobre o organismo e a parte do gene do que sobre a função. E a última linha é um aviso sobre esta ferramenta, não um exemplo para ela. O contexto de Kozak é o sinal que marca onde a tradução deve COMEÇAR; não é ele próprio uma grelha de leitura, e mesmo assim a ferramenta traduz-o alegremente como Ala-Thr-Met. Uma calculadora não te pode dizer se a tua pergunta faz sentido.
Problema resolvido na íntegra
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Um codão de três letras para dezoito bases e 33,3% de GC 5 passos
Dezoito bases, seis codões, 33,3% de GC. Determine por que razão um codão de três letras é o mais curto que poderia funcionar e o que se ganha com a capacidade excedente.
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A sequência divide-se em codões de três bases, pelo que dezoito bases dão seis — e o último é TAA, um codão de paragem, razão pela qual isto se lê como um gene curto completo.
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O teor de GC conta as bases G e C, seis em dezoito. É importante porque os pares G–C têm três ligações de hidrogénio em comparação com as duas dos pares A–T, pelo que uma sequência rica em GC funde a uma temperatura mais elevada.
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Agora, a questão do tamanho. Quatro bases tomadas duas a duas dão 16 combinações — menos do que os 20 aminoácidos que têm de ser codificados, pelo que os pares não podem funcionar.
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Três a três dão 64, para 21 elementos a designar contando com o sinal de paragem. Três é, portanto, o comprimento de palavra mais curto viável, e foi deduzido antes de ser observado.
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Ficam assim 64 combinações a mapear em 21, sensivelmente três codões por significado. O excesso é investido na redundância, não na ambiguidade: vários codões designam o mesmo aminoácido, mas nenhum designa dois.
Resposta
A ferramenta apresenta 18 bp, 6 codões e 33,3% de GC. A redundância é a parte com consequências. Como os sinónimos diferem habitualmente na terceira base, uma mutação nessa posição frequentemente não altera nada — o código possui uma tolerância a erros intrínseca que é uma propriedade do mapeamento, e não de qualquer maquinaria de reparação. A grelha de leitura tem a propriedade oposta: elimine-se uma base e todos os codões seguintes são reagrupados, transformando o resto do gene numa sequência sem sentido. A mesma estrutura de três letras torna um tipo de erro quase sem custos e o outro catastrófico.
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Referências (6)
- The code the tool tabulates: F. H. C. Crick, L. Barnett, S. Brenner and R. J. Watts-Tobin, "General Nature of the Genetic Code for Proteins." Nature 192, 1227–1232, 1961.
- The error-minimising structure, and how strong that claim actually is: S. J. Freeland and L. D. Hurst, "The Genetic Code Is One in a Million." Journal of Molecular Evolution 47(3), 238–248, 1998.
- The sequence library below: where its bases were fetched from, accession by accession: NCBI Reference Sequence Database — HBB (NM_000518.5) and INS (NM_000207) coding sequences, and GFP (GenBank M62653.1). Retrieved 2026-08-06.
- And the result the first two rows of that table exist to show: V. M. Ingram, "Gene mutations in human haemoglobin: the chemical difference between normal and sickle cell haemoglobin." Nature 180, 326–328, 1957 — one amino acid.
- The jellyfish protein that made cell biology visible: D. C. Prasher, V. K. Eckenrode, W. W. Ward, F. G. Prendergast & M. J. Cormier, "Primary structure of the Aequorea victoria green-fluorescent protein." Gene 111(2), 229–233, 1992.
- And the context that tells a ribosome where to start, which is the last row and not a gene: M. Kozak, "An analysis of 5′-noncoding sequences from 699 vertebrate messenger RNAs." Nucleic Acids Research 15(20), 8125–8148, 1987.