Problème entièrement résolu
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Une lecture de 2,49, et une concentration valant ±107 9 étapes
Un dosage enzymatique est lu à 340 nm dans une cuve de 1 cm. L'écran affiche 2,49 et l'analyste note 400 µmol/L de NADH. L'arithmétique est correcte. Évaluez la qualité de cette mesure, trouvez la procédure appropriée et déterminez ce que l'appareil affichait réellement.
Ouvrez ce problème dans l'outil
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Le NADH absorbe à 340 nm avec une absorptivité molaire de 6 220 L mol⁻¹ cm⁻¹. La concentration est de 400 µmol/L, soit 4,0000 × 10⁻⁴ mol/L, et la cuve mesure 1 cm de large. C'est toute l'étendue de la loi, et l'outil affiche le produit sous Absorbance A.
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L'absorbance se définit par −log₁₀T. En inversant la formule, on constate qu'environ trois photons sur mille sortent de la cuve. Tout ce que l'analyste s'apprête à affirmer repose sur la capacité de l'instrument à distinguer cette quantité de deux ou quatre photons sur mille.
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L'instrument mesure T. Écrivez c en fonction de T et dérivez la fonction. Les termes ε et ℓ apparaissent à la fois dans la dérivée et dans la concentration, ce qui les annule. L'incertitude relative ne dépend donc que de la lecture.
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Un bon instrument de paillasse est précis à environ 0,5 % de l'échelle de transmittance, donnant σT = 0,005. Réécrire l'expression en termes de A plutôt que de T permet d'utiliser le nombre déjà produit à la première étape. L'outil affiche 26,85 % sous Incertitude sur la concentration : la réponse est de 400 µmol/L à 107 près.
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Le dénominateur T ln(1/T) doit être le plus grand possible. Il possède un seul maximum. Sa dérivation donne −ln T − 1, qui vaut zéro à T = 1/e. La meilleure lecture disponible se situe donc à A = log₁₀e = 0,4343. L'incertitude y vaut e·σT = 1,36 %. La mesure de l'analyste a coûté 19,75 fois cette valeur.
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Lire trop pâle coûte 2,01× à A = 0,1. Lire trop foncé coûte 53,26× à A = 3. Bien que ces deux lectures se trouvent à une distance comparable de l'optimum, leur perte en exactitude n'a plus rien en commun. C'est la raison pour laquelle le panneau des erreurs utilise un axe logarithmique. Cela explique aussi pourquoi les laboratoires conseillent de diluer plutôt que de concentrer.
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Il faut donc diluer. L'opération 2,4880 ÷ 0,4343 = 5,73 amène l'échantillon à 69,82 µmol/L, soit le chiffre figurant sous Concentration à l'optimum. Une seule étape de pipetage permet au même instrument de répondre 19,75 fois plus précisément. La dilution comporte sa propre incertitude qui s'ajoute en quadrature. Elle devrait excéder 26,8 % pour rendre ce compromis désavantageux.
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L'écran n'a d'ailleurs rien affiché de tout cela. Avec 0,1 % de lumière parasite, l'instrument rapportait 2,3720. C'est 4,7 % de moins que l'absorbance produite par la chimie. Il n'aurait de toute façon pas pu afficher plus de 3,0004 quel que soit le contenu de la cuve. La valeur de 2,49 notée par l'analyste cumulait déjà deux erreurs avant même l'intégration de l'incertitude.
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Un monochromateur ne délivre jamais une seule longueur d'onde. Supposons que la moitié du faisceau se situe là où ε est 20 % plus faible, ce qu'une largeur de fente finie provoque généralement sur le flanc d'un pic d'absorption. Le détecteur additionne les deux intensités puis calcule le logarithme. L'absorbance apparente tombe ainsi sous la moyenne des deux pondérée par l'intensité. Pour un A nominal de 1, l'instrument indique 0,8886 contre une moyenne de 0,9000. Pour un nominal de 2, il affiche 1,7555 contre 1,8000. Ce déficit augmente avec la concentration, courbant la ligne d'étalonnage vers l'axe de la concentration au lieu de simplement la décaler. Si vous ancrez un étalonnage à un point sur l'optimum et que vous l'utilisez à A = 3, la concentration ressortira à 3,03 % de moins. Le panneau ci-dessus omet ces phénomènes. L'ajout d'un deuxième ε et d'un dédoublement de faisceau nécessiterait trois paramètres supplémentaires par rapport à ce que propose cette page.
Réponse
400 µmol/L à 107 près. L'arithmétique était bonne, mais la lecture s'est faite au mauvais endroit : 0,33 % du faisceau a traversé la cellule, entraînant 26,85 % d'erreur sur la concentration. L'incertitude est 19,75 fois supérieure à celle que le même instrument aurait donnée à A = 0,4343.
Diluer de 5,73× pour atteindre 69,82 µmol/L donne 69,82 ± 0,95, ce qui donne 400 ± 5,4 en multipliant à rebours. L'échantillon est le même, tout comme l'instrument et le jour de la mesure.
De plus, le 2,4880 n'est jamais apparu sur l'écran. La lumière parasite en a soustrait 4,7 % avant même la moindre lecture par l'analyste. -
Références (5)
- The concentration half of the law, and the paper the name comes from: August Beer, "Bestimmung der Absorption des rothen Lichts in farbigen Flüssigkeiten", Annalen der Physik 162(5), 78–88, 1852. doi:10.1002/andp.18521620505
- Who actually wrote what, which the usual attribution gets wrong: Heinz G. Pfeiffer and Herman A. Liebhafsky, "The origins of Beer's law", Journal of Chemical Education 28(3), 123, 1951. doi:10.1021/ed028p123
- The photometric error curve that carries their names: F. Twyman and G. F. Lothian, "Conditions for securing accuracy in spectrophotometry", Proceedings of the Physical Society 45(5), 643–662, 1933. doi:10.1088/0959-5309/45/5/304
- An openly readable derivation of the same result, in the same notation: "13.3: Effect of Noise on Transmittance and Absorbance Measurements", Instrumental Analysis, Chemistry LibreTexts (CC BY-NC-SA 4.0).
- Where the 6,220 L mol⁻¹ cm⁻¹ for NADH at 340 nm comes from: B. L. Horecker and Arthur Kornberg, "The extinction coefficients of the reduced band of pyridine nucleotides", Journal of Biological Chemistry 175(1), 385–390, 1948. doi:10.1016/S0021-9258(18)57268-9