レッスン
理論 — 偽の発見
ある研究分野における知見の 陽性的中率(PPV)とは、統計的に有意とされた結果のうち真実であるものの割合を指します。検証される仮説のうち真であるものの割合を π、有意水準 α における各研究の検出力を P、有意差の出なかった分析が発見として報告される割合を u とすると、真の仮説が発見となる確率は P + u(1 − P)、偽の仮説が発見となる確率は α + u(1 − α) となります。したがって PPV = π[P + u(1 − P)] / (π[P + u(1 − P)] + (1 − π)[α + u(1 − α)]) が成り立ちます。これはジョン・イオアニディスが2005年に発表した公式であり、原論文のオッズ R = π/(1 − π) の代わりに π を用いて表したものです。同じ検出力で誠実に行われた追試は、全発見のうち PPV·P + (1 − PPV)·α を再現します。
各記号の意味
π- その分野で検証される仮説のうち、真であるものの割合
P- 各研究の検出力(1 − β):真の効果を検出する確率
α- 有意水準(0.05):偽の仮説を検証した研究が p < 0.05 に達する確率
u- バイアス:有意差が出なかったにもかかわらず発見として報告される分析の割合
PPV- その分野の発見のうち、真実であるものの割合
- 前提
- 同一分野のすべての研究が同じ検出力を持つこと。各仮説は出版前に一度だけ検証されること。バイアスは有意差の出なかった結果にのみ作用すること。すべての発見が出版され、かつ発見のみが出版されること。追試は同一の検出力を持ち、バイアスのない同一の研究であること。なお、ここでの発見には効果量や効果の向きは考慮されていません。有意な研究が効果をどれほど過大評価するかという問題は、ひとつ前の単元である『勝者の呪い』で扱いました。
全プロセスの詳細解説
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p = 0.04 が次の研究に約束するもの 4 ステップ
ある研究が両側検定で p = 0.04 を報告したとします。真の効果が、その研究で測定された値と完全に一致していると仮定しましょう。同一の実験計画、同一のサンプルサイズで行う全く同じ追試が、同一の方向で p < 0.05 に達する確率はどれほどでしょうか。 得られた検出力を本ツールに入力し、真の仮説が10に1つ、バイアスなしとして、そうした分野の発見のうち本物が占める割合と追試の再現率を読み取ってみてください。
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p値を、それが算出された元のz値へと逆算します。両側検定なので左右の裾はそれぞれ0.02であり、p < 0.05 の境界となるのは上側確率が0.025となる点です:
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真の効果が観測値と等しいなら、追試におけるz値は平均 2.054、標準偏差 1 の正規分布に従います。追試が成功するのは、この値が 1.960 を上回るときです:
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−1.960 を下回った場合は逆向きの有意差となり、再現とは言えません。いずれにしても、その確率は無視できるほどわずかです:
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p = 0.04 の研究分野 を押してください。検出力54%(スライダーは1%刻み)、真の仮説は10に1つ、バイアスなしの設定です。
解答
53.7%。コイン投げよりわずかにましな程度であり、p = 0.05 であれば全く同じ計算手順でちょうど 50% になります。しかもこれは甘めの見積もりです。ひとつ前の単元で学んだ『勝者の呪い』が示す通り、有意差の出た研究は効果を過大評価しがちであるため、実際の追試における検出力はこれよりもさらに低くなります。検出力54%の研究が行われる分野では、真の発見は全体の54.5%にとどまり、追試で再現されるのは31.7%です。同一の仮定のもとで追試が5回に4回の確率で成功するためには、元の研究で p = 0.005 が得られている必要があり、その場合の検出力は80.2%となります。
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学習の道すじ
p < 0.05 が保証してくれないこと
参考文献 (1)
- The page's model and formula: the positive predictive value of a claimed finding from power, the pre-study odds R and the bias u (Tables 1 and 2), the condition that a finding is more likely true than false when (1 − β)R > α, which the first insight quotes, the definition of u the second insight paraphrases, and Table 4, whose first row is the 'Ioannidis's trial' preset and all nine of whose rows check:compute reproduces: J. P. A. Ioannidis, "Why Most Published Research Findings Are False," PLoS Medicine 2(8): e124, 2005.