Õppetund
Teooria — SIR-epideemiamudel
Epideemial on kaks erinevat lõppu, ja see leht trükib mõlemad. Karjaimmuunsuse lävi on punkt, kus iga nakkus lakkab tootmast rohkem kui üht järglast — kus kõver pöördub. Haigestumusmäär on see osa rahvastikust, kes on nakatunud selleks ajaks, kui kõik on tõesti läbi. Need ei ole sama arv, need ei ole kunagi sama arv, ja just nendevahelisest kaugusest see õppetükk räägibki.
Mida iga sümbol tähendab
R₀- baasreproduktsiooniarv
β/γ— mitu inimest nakataks üks nakkus rahvastikus, kus kõik on veel vastuvõtlikud. Kahe määra suhe, seega kirjeldab ta haigustekitajat keskkonnas, mitte kunagi haigustekitajat üksinda. s- vastuvõtlike osakaal
S/N. Peaaegu kõik alljärgnev on väide selle suuruse, mitte aja kohta — just seepärast ei sõltu tulemused sellest, kui kiiresti puhang kulgeb. H- karjaimmuunsuse lävi
1 − 1/R₀: immuunsete osakaal, mille juures kasv peatub. Leht trükib selle. A- haigestumusmäär — kunagi nakatunute osakaal, kui
Ion tagasi nulli langenud. Ka see on lehel olemas, nimetusega „nakatunuid kokku“.
Kust valem tuleb
- Küsi, millal puhang kasvab. Nakkusohtlik osa muutub võrrandi
dI/dt = βIS/N − γIjärgi, mis teguriteks lahutades annabI(βs − γ). KunaIon puhangu ajal positiivne, otsustab märgi ainuüksi sulg: nakkus kasvab seni, kuniβs > γ, see tähendab kunis > γ/β = 1/R₀. Pane tähele, et see on tingimus vastuvõtlike osakaalu kohta ja aega pole selles kusagil. - Pöördepunkt on seega täpselt
s = 1/R₀, ja sel hetkel enam mitte-vastuvõtlike osakaal on1 − 1/R₀. See ongi karjaimmuunsuse lävi ja seesama arv, mille leht trükib — 33.3% gripi eelseade puhul, kusR₀ = 1.5. Sealsamas on ka nakatunute kõvera tipp, mida saab graafikul kontrollida: tipp pole kuju juhus, vaid just selle tingimuse täitumine. - Nüüd samm, mille tavaliselt vahele jäetakse. Lävel on
dI/dt = 0— aga see ei oleI = 0. Kohal on endiselt suur nakkusohtlik hulk ja igaüks neist nakatab edasi määragaβs. Vähem kui üks järglane igaühe kohta, seega arvud langevad; kuid tipust allalaskumine võtab aega ja iga selline nakkus tabab kedagi. Epideemia ei peatu lävel. Ta veereb sellest läbi. - Et leida, kus ta tegelikult lõpeb, tuleb ajast lahti saada. Jaga vastuvõtlike võrrand tervenenute omaga:
dS/dR = −(β/γ)(S/N) = −R₀s, mis integreerub kujules = s₀·e^(−R₀·r), kusron tervenenute osakaal. Lõpuks pole enam kedagi nakkusohtlikku, seegar∞ = 1 − s∞, ja asendades saame lõppsuuruse seose:s∞ = s₀·e^(−R₀(1 − s∞)). Haigestumusmäär onA = 1 − s∞. See on transtsendentne —s∞esineb nii eksponendi sees kui väljaspool —, seega suletud kuju pole olemas, ja just seepärast see leht integreerib, mitte ei arvuta valemit. - Pane need kaks arvu kõrvuti ja vahe ongi ülelend.
R₀ = 1.5juures trükib leht läveks 33.3% ja kokku 58.5%: puhang lendab 25 punkti üle selle koha, kus ta kasvamast lakkas. MuudaR₀-i ja ülelend ei ole monotoonne — see tõuseb umbes 30 punktiniR₀ ≈ 2lähedal ja langeb siis taas, kadudes niiR₀ → 1korral, sest miski eriti ei levi, kui ka suurteR₀juures, sest lävi ja haigestumusmäär suruvad mõlemad 100% vastu.R₀ = 5juures on need 80.0% ja 99.3%; leetrilaadseR₀ = 15juures 93.3% ja 100.0%. Kõige suurem ülelend jääb täpselt pandeemilise gripi ja varase SARS-CoV-2 vahemikku.
Kuidas nähtut lugeda
Kolm kõverat ja kolm arvu. Kõverad on osakonnad; jälgimist väärib nakkusohtlike küür, mille tipp ongi samm 2 toimumas. Arvudest vastavad „tipphetkel nakatunuid“ ja „nakatunuid kokku“ täiesti erinevatele küsimustele — esimene ütleb, kui paljud on haiged korraga, mis loeb haiglate jaoks, teine aga, kui paljud on haiged olnud mingil hetkel, mida ennustab lõppsuuruse seos. Gripi eelseade puhul on need 6.4% ja 58.5%, ja esimene ei ütle teise kohta midagi. Nende kohal olev karjaimmuunsuse lävi pole kumbki neist: see on koht, kus esimene pöördub.
- Eeldab
- Suletud ja hästi segunenud rahvastik — ei sünde, ei surmi, ei reisimist, ja iga vastuvõtlik kohtub iga nakkusohtlikuga võrdse tõenäosusega. Püsivad
βjaγ, seega ei käitumismuutust, ei aastaaegu, ei sekkumisi poole peal. Püsiv immuunsus, keegi ei naase vastuvõtlike hulka. Ja determineeritud mudel — just seepärast käivitab käputäis nakkusohtlikke siin alati puhangu, samal ajal kui tegelikkuses hääbuvad väikesed arvud sageli juhuslikult ka siis, kuiR₀ > 1. - Ei kehti, kui
- Väljend „karjaimmuunsuse lävi“ kutsub esile lugemisviisi, mida matemaatika ei toeta: nagu lõpeks omapead jäetud epideemia seal. Ei lõpe — ta lõpeb haigestumusmääral, mis samm 5 järgi võib olla 25 punkti kõrgemal. Lävi on vaktsineerimise siht, tase, milleni saab jõuda ilma epideemiata; nakatumise teel saavutatuna maksab see läve ja ülelennu pealekauba. See vahetegemine polnud 2020. aastal sugugi akadeemiline. Veel kaks hoiatust neile, kes neid arve tõsiselt võtavad: hea segunemine on siin kõige ebarealistlikum eeldus ja selle lõdvendamine alandab üldjuhul nii läve kui ka haigestumusmäära, sest tugevalt seotud inimesed nakatuvad varakult ja lakkavad olemast sillad; ning see leht alustab kümnest nakkusohtlikust, mitte lõpmatult väikesest algidust, mistõttu selle 58.5% jääb napilt üle klassikalise
s₀ → 1piirjuhu 58.3%.
Ülesanne täielikult lahendatud
-
Nakkuse, mille R₀ = 3, levik immuunsest osast mööda 5 sammu
Nakkuse R₀ = 3. Leia immuunsete osakaal, mis on vajalik selle leviku peatamiseks — ja näita, et epideemia jätkab kasvu ka pärast seda punkti.
-
R₀ on keskmine uute haigusjuhtude arv, mida üks juhtum tekitab täielikult vastuvõtlikus populatsioonis: edasikandumise kiirus jagatud tervenemise kiirusega. See on kahe kiiruse suhe, mistõttu sel ei ole ühikuid ega ajaskaalat.
-
Puhang kasvab seni, kuni iga haigusjuht taastoodab iseennast. Kui osa populatsioonist on immuunne, loeb vaid vastuvõtlike osakaal, seega jätkub kasv täpselt seni, kuni see osakaal ületab väärtust 1/R₀.
-
Pööra see ümber. Ülaltoodud simulaator väljastab selle künnise ja see on kogu vaktsineerimispoliitika alus — kunagi ei ole vaja jõuda kõigini.
-
Kuid künnis on koht, kus kasv peatub, mitte kus epideemia peatub. Nakatunud inimesed on sel hetkel endiselt nakkusohtlikud, seega koguneb haigusjuhte ka pärast seda.
-
See ületus on põhjus, miks tipp ja künnis on erinevad arvud ning miks leevendamata epideemia lõpeb künnisest palju suurema nakatunute osakaaluga.
Vastus
66.7%. Tipp saabub umbes 30% korraga nakatunutega ja — mis on kõige kergemini märkamata jääv detail — epideemia jätkub ka pärast künnist, mitte ei peatu seal, seega ületab lõppsuurus künnise oluliselt. Karjaimmuunsus väljendab hetke, mil kõver pöördub, mitte puhangu lõppu. Ning kuna künnis on 1 − 1/R₀, on see ülaosas julmalt tundlik: leetrid väärtusel R₀ ≈ 15 vajavad 93.3% hõlmatust, mistõttu leetrid naasevad alati esimesena, kui vaktsineerimistase langeb.
-
Õpitee
Piiratud kasv
Allikad (3)
- The compartment model and the threshold theorem this tool implements: W. O. Kermack & A. G. McKendrick, "A contribution to the mathematical theory of epidemics." Proceedings of the Royal Society A 115, 700–721, 1927.
- The lesson's step 4 — where the transcendental final-size relation comes from: J. C. Miller, "A Note on the Derivation of Epidemic Final Sizes." Bulletin of Mathematical Biology 74(9), 2125–2141, 2012.
- Thresholds, final sizes and the overshoot, treated together: H. W. Hethcote, "The Mathematics of Infectious Diseases." SIAM Review 42(4), 599–653, 2000.